
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
理论研究报告单
研究探讨考生探究性根据冷冻冷冻箱时加长羊肉的对抗强度、持水力发电、色调、自由态铁含铁的、ROS、脂质过阳极铁的氧化物、MDA、GSH和GPX4技能来考评肌肉团队团队血细胞核的铁去世方式。結果表明,冷冻冷冻箱时加长后,羊肉的对抗强度在第5天和第6天取得回落;持水技能变低;色泽变深,失有光泽度,鲜鲜橘红色化为暗鲜橘红色。另外,自由态铁、生物氧和MDA的含铁的取得提升,血细胞核凋亡率取得提高。 深入介绍人员管理获取不一冷冻冷藏时间的手臂胸肌原辅料的膳食纤维质酶酶质,而后开始SDS-PAGE介绍,膳食纤维质酶酶质条带在不一时间地域分布匀且相同(图1a)。随着膳食纤维质酶酶在不一原辅料中的传达现状,介绍发觉相同组原辅料的中数字表示于相同水平方向(图1b),这说明手臂胸肌原辅料膳食纤维质酶酶质具有着优异的组内相同性和组间不同性。 球营养物质组学共亲子技术检测出1996种球营养物质。以B0为比较组,挑选B1、B2、B4和B6中的球蛋清来进行距离形容分折,共亲子技术检测到37七个DEPs。将火山图多维阐述,并依据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05多个规格分折DEP。結果如同1c-f提示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别亲子技术检测出22、33、73和140个DEPs,这其中分发型别上浮6、11、32和89个,调整16、22、41和58个。聚类分析具体方法评估报告格式了各种速冻时段腹肌组建中球营养物质的形容,結果信息显示腹肌球蛋清形容距离跟随贮藏时间段的增长而增长(图1g)。
图1| 区别保鲜日期的背部肌肉图纸蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 区别保温时光的胸肌印刷品区别蛋清阐述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身故淀粉酶肽的PRM按量分折(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依托于KEGG聚集差距理解淀粉酶的铁身故机理(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT参考值脂肪酸质组学的高技术咨询保障,拜谱生态学已研发项目管理达成并建设了更加完善比较成熟的转录组学、脂肪酸组学、排泄组学和几组学联手物料的高技术咨询保障系统,欢迎致电咨询!
参阅医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.