
近日,杭州医科学校时1加盟卫生院王学浩科学院院士销售团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向疗法正能量排泄检测分析服务。
英文翻译版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文副标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
大家机关单位:南京医科大学
调查物料:细胞
拜谱能提供服務:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向疗法势能分解代谢组
能力自驾路线:
研究方案可是
01、YBX1被评定为HCC中糖酵解的最为关键的dna
本探讨采集器HCC肉瘤样板(n=7)的单血神经元RNA测序信息集开展讲解,得知糖酵解活性氧最主要汇聚在肉瘤血神经元中,hdWGCNA讲解认别出9个基因组信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的求经营讲解来确定YBX1为独立自主求经营危害性原因(图1H)。进这一步结合在一起IHC、WB实验室和肉瘤安排与临近非肉瘤安排的余地转录组学信息集核实YBX1是肝血神经元癌中药治疗的潜在性的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确认为可以调节HCC组织细胞糖酵解的关健基本要素
02、YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗卡路里新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1利于HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1配合并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,血清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合起来并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增強其磷碱化,所以有助于其核转位
进两步检查测量YBX1的O-GlcNAc糖基化要不要后果其磷过酸,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT压剂型OSMI-1操作,YBX1球蛋白质质标准更为明显减轻,YBX1磷过酸更为明显削减(图4A-C)。IP科学试验凸显,在同样的Flag-YBX1底物标准下,YBX1-WT的磷过酸标准更为明显高与YBX1-T57A,表面磷过酸的提高实际上仅是因此更好的YBX1球蛋白质质理解(图4D)。隔离了核和质多组分得知TMG操作的HCC神经元中YBX1核理解的变高(图4E-F),进两步得知YBX1磷过酸的主要改善因素是AKT(图4G-I)。这一些得知注重O-GlcNAc糖基化凭借力促其磷过酸来提高YBX1球蛋白质质平稳性并力促核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 突显助进于其进一个步骤发生了磷硝化作用突显并才可以推动其核转位
05、YBX1促进会PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推动PKM2转录
06、YBX1 可挺高组血清乳硝化作用呈现平均水平
科研显示YBX1敲低强势变低蛋清质乳过酸,特别的是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解治理和改善剂2-DG的实验室声明了糖酵解与组蛋清乳过酸的直观绑定,治理和改善糖酵解可强势变低H3K18la含量(图6D)。PKM2过形容可逆转转YBX1敲低造成的的H3K18la增涨,之外源乳酸治理 既发展H3K18la,还随之YBX1形容上浮,显示系统来源于双向上报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR声明,H3K18la确认丰度于YBX1启用子直观提高其转录,该操作过程受O-GlcNAc糖基化调节管控(图6H-J),并显示P300 上浮是YBX1改善H3K18乳酰凝成用的缘由(图6K-L)。
图6.YBX1强化H3K18乳过酸遮盖平行
句子工作小结
在某项钻研中新闻报道了YBX1在HCC中高体现,那么与糖酵解密码切重要性联。YBX1在T57处被O-GlcNAc呈现,所以平衡核蛋白酶质并曾加其体现。这款呈现还使得YBX1在T57处的磷硝化作用,使得其核易位。那么,一项历程促进了糖酵解重要性联DNA组的转录并条件刺激乳酸的存在。还有,YBX1成功激活P300的转录,因而能够组核蛋白酶的乳硝化作用,尤其是H3K18la,H3K18乳硝化作用单向宏观调控YBX1DNA组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因双面馈环制度化图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点能量场代谢率组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻译工作后表达组学、代谢率组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
考虑文献资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.