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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 线上药学学探求草酸钙肾结石防氧化应激性和慢性炎症伤到体制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿整体最应见的疾病症状之1。肾组织化中CaOx尖晶石过供大于求沉积状会造成 肾小管内部挤压伤和凋亡,而使造成 肾结石的演变成。短链皮下油脂酸由肠内内活性污泥法疾病沤肥伙食植物纤维诞生,不只是在部分肠内障壁中更好地发挥效应影响,但是在整体水平方向上也更好地发挥效应关健影响。进来,丁酸是最非常丰富的短链皮下油脂酸,具消除炎症和天然免疫促使影响,本设计浅议丁酸对CaOx肾结石的影响基本潜在性的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山大医院泌尿整形外科吴忠教学、周子健博后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健博土在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网洛药剂学学服务的,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

的文章名字:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 大家公司:华山医院口腔科 实验项目:大鼠、HK-2肿瘤细胞 排列信心:相较比较组(Con)、模型工具组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱能提供技艺:电脑网络临床药理学查测

思维具体流程

科学研究报告

研发员一方面建设大鼠三维类别,能够 身理生化模式目标和结构病理学学染料等研发伎俩出现 丁酸能缩减CaOx三维类别大鼠肾CaOx多晶体的达成和挤压伤,提高CaOx三维类别大鼠的支原体感染挤压伤和硫化化学物质的优化表达出。虽然,丁酸还可抑止草酸介导的HK-2人体細胞挤压伤、硫化应激性和人体細胞凋亡。 为实验设计丁酸结构的设计和靶什么是染色体网上,研发人群从PubChem了解丁酸和丁酸酯的二维和3D结构的设计(图1A)。用PharmMapper数值库和Uniprot数值库清理后共建立出119个丁酸靶什么是染色体供进步骤介绍。将什么是染色体所有拷贝到STRING数值库,完成PPI网上介绍。Cytoscape根据了重新排列的前20的核心区靶什么是染色体的详尽网上图,其重点包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。哪些核心区什么是染色体与网上中的另外什么是染色体均症状出务必的核心性性,这说明哪些什么是染色体可以充分展现着协同作战意义。GO和KEGG介绍探求了丁酸核心区什么是染色体的核心性条件和怪物学能力(图1C)。核心区什么是染色体其重点与类固醇雄激素类初次回复、脱色应激状态性初次回复、可溶性氧内部对类固醇雄激素类促使的不良不起用处及其对咸性生物技术有机化合物的不良不起用处有关系。上述情况根据上述,哪些核心区什么是染色体其重点加入了脱色应激状态性和对可溶性氧的怪物不良不起用处方式,是肾结石达成长效机制中至关核心的条件,这反映丁酸可以在肾结石中充分展现核心意义。

图1| 丁酸型式与靶基因组网具体分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进的一步宇宙探索丁酸对CaOx肾结石当然切靶dna,设计员使用GEO动态orcale对GSE73680中健康生活对应与CaOx肾结石病员的dna的差异对其来了设计。对应组与CaOx结石病员的同质性性性的差异描述爱dna(DEGs)检查要求为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个dna造成同质性性转变,表中3379个(89.4%)dna描述爱调整,404个(10.6%)dna描述爱下降(图2A)。对DEGs对其来聚类算法解析法解析,热图表示了前10个被选中DEGs的二维层次聚类算法解析法症状(图2B)。其次,设计员凭借GeneCards动态orcale人工费鉴别了370个或许与CaOx肾结石一些的dna,排民前20位的予测dna下列关于一些性评判图甲2C已知。只为搜到丁酸缓解CaOx肾结石的核心靶点,设计员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石一些dna处里能够得到好几回个Venn图。结果是,CYP2C9被敲定为丁酸直接影响CaOx肾结石的内在的靶点(图2D)。于此,设计员还对其来了丁酸与CYP2C9的分子结构联结,CYP2C9的二个胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互之间的作用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在根据无线网络药剂学学預测CYP2C9是丁酸应响CaOx肾结石的靶基因遗传后,探析人还确认组织检测得知了CYP2C9可降低草酸成脂的HK-2组织的ROS水平面、细菌感染伤害和凋亡。

图2| 而言据库合力了解分析CYP2C9是丁酸使用于CaOx肾结石的靶表观遗传

科研结果显示

本研究探讨第一步发掘丁酸在身体和内部均能治理和改善CaOx肾结石沙盘模型的脱色应激性性和真菌感染伤害,随着实现无线网洛药剂学学挑选到丁酸的影响CaOx肾结石的隐性靶点——CYP2C9,最终实现体血细胞實驗查证CYP2C9在草酸盐引诱的HK-2体血细胞ROS标准、真菌感染伤害和凋亡。这样的发掘意味着丁酸机会实现治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的脱色应激性性,改善真菌感染伤害。这一个期间中拜谱生态学带来了无线网洛药剂学学工艺的服务项目,不仅如此拜谱生态学可提升成熟期进一步优化的表观遗传组学、蛋清质组学、分泌组学等多个学软件及工艺的服务项目,欢迎辞呼叫网络咨询! 参看文献资料:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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