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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直以来算作医药化工材料而被熟悉的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分泌废品”为“宝藏地图小分子式”的苦不堪言成果相类似,终会近三十年才被表明其注重的菌物学作用,从次“平躺农奴把声乐”,特点是在免疫系统发炎性的常见疾病探究方面内与时共进。多个篇文献资料新闻稿了在各式发炎性的常见疾病的動物绘图中给衣康酸或其检查是否体现衍菌物的制疗益处,并表明其存在靶点。有关衣康酸的“前世姻缘”与“此生”,详细推书《乳酸的奋斗史好兄弟——衣康酸!选文和你一起熟悉衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应绘制蛋清组学产品,实现1000+玄之又玄度体现位点验出,稳固初现经典爱情靶点,全座向生信探讨解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“挖掘”到“证实”全方案功能,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实践步奏

02、实际大数据

03、经“点”重新

在试验数据显示中,验出数个专著中新闻稿的经典的靶点和其衣康酸呈现位点,如第一次个被显示的衣康酸共价呈现核蛋清质KEAP1,同时还有糖酵解径路中的3个首要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,以其炎性小体分解成核蛋清质NLRP3和组织挫裂环节中的首要核蛋清质RIPK3等,其质谱图以下图提示。

04、设备结构特征

1.众多质控

工业化特女性朋友加测器孵育、SDS-PAGE加测、WB核实、样版涉及性研究分析等相互位加测,确认工程项目效果牢靠性。

2.高性质谱机器设备工作平台

在Orbitrap Astral全新第九代高判定质谱仪六道金刚咒下,构建衣康酸性反应遮盖位点及血清签别新长度,推助科学实验理论研究新找到。

3.全程序站台式工作

因为拜谱菌物不断完善的工作APP,可给予“受损细胞培训→电极孵育→WB查重→玄妙度衣康硝化作用掩盖查重→专享生信深入分析→某位点PRM验正”全程序功能,省时省钱呢更省钱。

05、探讨信息(局部)

06、软件目标

PART 2、论文参考文献安利

文献综述一

日语主题词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

英文版小标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

设计信息内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

文章二

英文音标微信标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常主题词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究分析相关内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、范例双重性基本思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13存在很强的底物结合实际工作能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱动物衣康过酸表达组场地实测数剧中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化掩盖(正确图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

成为TCA重复中的间消化吸收物,衣康酸改善消化吸收、免疫力力检测和皮肤疾病症状两者的能够 用,为方法免疫力力检测皮肤疾病症状内分泌皮肤疾病症状出示了取代方法方案。衣康酸空间结构特征中的亲电性α,β-不趋于稳定羧酸空间结构特征能对核高核蛋白上的亲水性半胱氨酸残基确定烷基化绘制(迈克尔加上发生反应),某种英译后绘制被称呼“衣康酸绘制(itaconation)”,于是导致核高核蛋白效果,干预免疫力力检测对答和消化吸收条件,为许多种皮肤疾病症状用量技术创新出示新指导思想。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化遮盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床绝参考值靶向药物细胞代谢组(QMT1000)或势能产生转化靶向治疗产生转化组厂品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

学习专著

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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